Wierzchucice usytuowane jest w województwie kujawsko-pomorskim, 15 kilometrów na północny-zachód od Bydgoszczy, po wschodniej i zachodniej stronie Jeziora Wierzchucińskiego Małego oraz zachodnio-północnej stronie Jeziora Wierzchucińskiego Dużego w bardzo bliskim sąsiedztwie wsi Wierzchucinek.